菌種鑒定包括：細菌、酵母、放線菌絲狀真菌等微生物

健明迪檢測長期從事菌種分類鑒定工作，為國內科研機構、大專院校和生產企業等提供微生物菌種鑒定服務，菌種鑒定是綜合應用分子生物學信息、細胞化學組分數據、菌株生理生化特性、菌落和細胞形態學特征的多相分類學手段確定純培養物的分類地位。

健明迪檢測常用通過DNA 測序對微生物進行物種鑒定（菌種鑒定）是比傳統生化鑒定更先進的鑒定方法。DNA 測序不依賴菌種本身特點，對所有菌種均可使用。比傳統生化鑒定更加快速，準確。健明迪檢測微生物鑒定服務包括細菌16s rDNA鑒定和真菌26s rDNA鑒定、真菌ITS和真菌18s 鑒定。

菌種鑒定手段包括形態學觀察、生理生化特性鑒定、 BIOLOG碳源自動分析鑒定、分子生物學鑒定、API細菌數值鑒定、功能性分析及功能基因、RAPD、SSCP、TLC薄層層析、全細胞脂肪酸分析鑒定、（G＋C）mol％測定、DNA/DNA同源性測定等。

菌種鑒定手段包括形態學觀察、生理生化特性鑒定、 BIOLOG碳源自動分析鑒定、分子生物學鑒定、API細菌數值鑒定、功能性分析及功能基因、RAPD、SSCP、TLC薄層層析、全細胞脂肪酸分析鑒定、（G＋C）mol％測定、DNA/DNA同源性測定等。